TY  - JOUR
ID  - ef-10-1
TI  - Genomic surveillance elucidates Ebola virus origin and transmission during the 2014 outbreak
AU  - Gire, Stephen K.
AU  - Goba, Augustine
AU  - Andersen, Kristian G.
AU  - Sealfon, Rachel S. G.
AU  - Park, Daniel J.
AU  - Kanneh, Lansana
AU  - Jalloh, Simbirie
AU  - Momoh, Mambu
AU  - Fullah, Mohamed
AU  - Dudas, Gytis
AU  - Wohl, Shirlee
AU  - Moses, Lina M.
AU  - Yozwiak, Nathan L.
AU  - Winnicki, Sarah
AU  - Matranga, Christian B.
AU  - Malboeuf, Christine M.
AU  - Qu, James
AU  - Gladden, Adrianne D.
AU  - Schaffner, Stephen F.
AU  - Yang, Xiao
AU  - Jiang, Pan-Pan
AU  - Nekoui, Mahan
AU  - Colubri, Andres
AU  - Coomber, Moinya Ruth
AU  - Fonnie, Mbalu
AU  - Moigboi, Alex
AU  - Gbakie, Michael
AU  - Kamara, Fatima K.
AU  - Tucker, Veronica
AU  - Konuwa, Edwin
AU  - Saffa, Sidiki
AU  - Sellu, Josephine
AU  - Jalloh, Abdul Azziz
AU  - Kovoma, Alice
AU  - Koninga, James
AU  - Mustapha, Ibrahim
AU  - Kargbo, Kandeh
AU  - Foday, Momoh
AU  - Yillah, Mohamed
AU  - Kanneh, Franklyn
AU  - Robert, Willie
AU  - Massally, James L. B.
AU  - Chapman, Sinéad B.
AU  - Bochicchio, James
AU  - Murphy, Cheryl
AU  - Nusbaum, Chad
AU  - Young, Sarah
AU  - Birren, Bruce W.
AU  - Grant, Donald S.
AU  - Scheiffelin, John S.
AU  - Lander, Eric S.
AU  - Happi, Christian
AU  - Gevao, Sahr M.
AU  - Gnirke, Andreas
AU  - Rambaut, Andrew
AU  - Garry, Robert F.
AU  - Khan, S. Humarr
AU  - Sabeti, Pardis C.
JO  - Science
PY  - 2014
DO  - 10.1126/science.1259657
UR  - https://doi.org/10.1126/science.1259657
ER  - 


TY  - JOUR
ID  - ef-10-2
TI  - Real-time, portable genome sequencing for Ebola surveillance
AU  - Quick, Joshua
AU  - Loman, Nicholas J.
AU  - Duraffour, Sophie
AU  - Simpson, Jared T.
AU  - Severi, Ettore
AU  - Cowley, Lauren
AU  - Bore, Joseph Akoi
AU  - Koundouno, Raymond
AU  - Dudas, Gytis
AU  - Mikhail, Amy
AU  - Ouédraogo, Nobila
AU  - Afrough, Babak
AU  - Bah, Amadou
AU  - Baum, Jonathan H. J.
AU  - Becker-Ziaja, Beate
AU  - Boettcher, Jan Peter
AU  - Cabeza-Cabrerizo, Mar
AU  - Camino-Sánchez, Álvaro
AU  - Carter, Lisa L.
AU  - Doerrbecker, Juliane
AU  - Enkirch, Theresa
AU  - Dorival, Isabel García-
AU  - Hetzelt, Nicole
AU  - Hinzmann, Julia
AU  - Holm, Tobias
AU  - Kafetzopoulou, Liana Eleni
AU  - Koropogui, Michel
AU  - Kosgey, Abigael
AU  - Kuisma, Eeva
AU  - Logue, Christopher H.
AU  - Mazzarelli, Antonio
AU  - Meisel, Sarah
AU  - Mertens, Marc
AU  - Michel, Janine
AU  - Ngabo, Didier
AU  - Nitzsche, Katja
AU  - Pallasch, Elisa
AU  - Patrono, Livia Victoria
AU  - Portmann, Jasmine
AU  - Repits, Johanna Gabriella
AU  - Rickett, Natasha Y.
AU  - Sachse, Andreas
AU  - Singethan, Katrin
AU  - Vitoriano, Inês
AU  - Yemanaberhan, Rahel L.
AU  - Zekeng, Elsa G.
AU  - Racine, Trina
AU  - Bello, Alexander
AU  - Sall, Amadou Alpha
AU  - Faye, Ousmane
AU  - Faye, Oumar
AU  - Magassouba, N’Faly
AU  - Williams, Cecelia V.
AU  - Amburgey, Victoria
AU  - Winona, Linda
AU  - Davis, Emily
AU  - Gerlach, Jon
AU  - Washington, Frank
AU  - Monteil, Vanessa
AU  - Jourdain, Marine
AU  - Bererd, Marion
AU  - Camara, Alimou
AU  - Somlare, Hermann
AU  - Camara, Abdoulaye
AU  - Gerard, Marianne
AU  - Bado, Guillaume
AU  - Baillet, Bernard
AU  - Delaune, Déborah
AU  - Nebie, Koumpingnin Yacouba
AU  - Diarra, Abdoulaye
AU  - Savane, Yacouba
AU  - Pallawo, Raymond Bernard
AU  - Gutierrez, Giovanna Jaramillo
AU  - Milhano, Natacha
AU  - Roger, Isabelle
AU  - Williams, Christopher J.
AU  - Yattara, Facinet
AU  - Lewandowski, Kuiama
AU  - Taylor, James
AU  - Rachwal, Phillip
AU  - J. Turner, Daniel
AU  - Pollakis, Georgios
AU  - Hiscox, Julian A.
AU  - Matthews, David A.
AU  - Shea, Matthew K. O’
AU  - Johnston, Andrew McD.
AU  - Wilson, Duncan
AU  - Hutley, Emma
AU  - Smit, Erasmus
AU  - Di Caro, Antonino
AU  - Wölfel, Roman
AU  - Stoecker, Kilian
AU  - Fleischmann, Erna
AU  - Gabriel, Martin
AU  - Weller, Simon A.
AU  - Koivogui, Lamine
AU  - Diallo, Boubacar
AU  - Keïta, Sakoba
AU  - Rambaut, Andrew
AU  - Formenty, Pierre
AU  - Günther, Stephan
AU  - Carroll, Miles W.
JO  - Nature
PY  - 2016
DO  - 10.1038/nature16996
UR  - https://doi.org/10.1038/nature16996
ER  - 


TY  - JOUR
ID  - ef-10-3
TI  - Genomic infectious disease epidemiology in partially sampled and ongoing outbreaks
AU  - Didelot, Xavier
AU  - Fraser, Christophe
AU  - Gardy, Jennifer
AU  - Colijn, Caroline
JO  - Molecular Biology and Evolution
PY  - 2017
DO  - 10.1093/molbev/msw275
UR  - https://doi.org/10.1093/molbev/msw275
ER  -